培養基在使用之前必須進行滅菌處理，將其所含活菌全部殺死或全部除去。常用的滅菌方法有過濾除菌、干熱滅菌、濕熱滅菌及輻照滅菌等。其中，濕熱滅菌法又包括四種方式:煮沸法、流動蒸汽滅菌法、間歇滅菌法和壓力蒸汽滅菌法。通常來說，使用比較多的是壓力蒸汽滅菌法。
但是對于有些培養基來說,高壓條件會損壞培養基中的某些成分,不利于培養基的使用，所以只能采用煮沸滅菌的處理方法。本文主要就煮沸滅菌方法進行討論。
有關煮沸滅菌的描述,通常有如下幾種方式:
a、稱取本品41.5g,加熱溶解于1000mL蒸餾水中,煮沸不要超過2分鐘。無需高壓滅菌。臨用時制備，不得超過3小時。
b、稱取本品50.3g,加入1000mL蒸餾水中，加熱煮沸至完w全溶解，冷至45-50℃，搖勻，傾入無菌平皿備用。無需高壓滅菌。
c、稱取本品89g,煮沸溶解于1000mL蒸餾水中，冷至45-50℃時，傾入無菌平皿，備用。注:無需高壓滅菌。
d、稱取本品57g,加熱攪拌溶解于1000mL蒸餾水中，不要過分加熱，冷至50-55℃時，傾入無菌平皿,部分開蓋干燥2h,然后蓋上，備用。無需高壓滅菌。在24小時內使用。
這些方法描述中，都特別強調“無需高壓滅菌"、“不要過分熱"、“煮沸充分溶解",那么究竟該怎樣操作，才能達到既滅菌完w全又盡量降低對培養基的破壞呢?
1、關于煮沸方式，有人提出可以隔水煮沸，但經過反復試驗，發現這種煮沸方式存在兩大弊端:
①溫度不夠，達不到滅菌效果;
②經隔水煮沸的含瓊脂培養基,在水浴的過程中易出現分層現象。
2、為了對培養基進行有效煮沸滅菌,根據我們實踐摸索，建議如下操作:
①準備好電磁爐和搪瓷缸(不要用鐵質容器);
②將培養基按比例加水，稱量至搪瓷缸中，用玻璃棒不斷攪拌，直至完w全溶解、無明顯團狀物或顆粒;
③將搪瓷缸置于電磁爐上，大火燒開，期間持續攪拌,避免糊底;當液面完w全沸騰后，立即將搪瓷缸從電磁爐上拿開,算是一次煮沸操作;液面回落后，立即放回電磁爐,重復上面的步驟;總共煮沸3次即可。
④將煮好的培養基冷卻至需要的溫度,進行傾注平皿等操作。
注意事項
1、補水
加熱煮沸的過程，培養基中的部分水分會蒸發掉，造成水分偏少，影響培養基的質量(如平板強度等)，導致菌落形態等結果的偏差，因此為了盡量減少誤差,需要在煮沸之前，向搪瓷缸中補加適量培養基配制用水，經驗估計,通常每煮一缸培養基需補加15-20mL水，實際操作中，需根據各實驗室的具體情況(容器大小及裝量)進行摸索。
2、溶解
所有的培養基，在煮之前必須攪拌至完w全溶解，不允許將尚有成團培養基的狀態下，直接進行加熱煮沸,那樣很容易出現滅菌不徹d底的現象，尤其是有些含瓊脂的培養基,甚至會有部分瓊脂不能徹d底溶解，導致倒出的平皿上有明顯的麩皮狀瓊脂小顆粒，或者有些含有染料的培養基也可能出現染料顆粒,都會影響培養基的使用。
3、攪拌
煮沸全程必須持續不斷攪拌,以免糊底。
4、防燙
液面沸騰后，要及時將搪瓷缸從電磁爐上取下，以免液體沸出，造成培養基沾染或燙傷操作人員。
